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可視化量子化學計算程序 Chemcraft 1.8 Build 562 破解版

(認準閃電軟件園)
  • 更新時間:2019-10-21
  • 軟件大小:未知
  • 界麵語言:簡體中文
  • 授權方式:共享軟件
  • 運行環境:Win7/win8/win10
  • 官方網站:閃電軟件園

軟件標簽:Chemcraft Chemcraft破解版 
Chemcraft破解版是功能強大的是用於量子化學計算程序,軟件支持通過原子坐標繪製分子的3維圖像,並可以檢查或修改分子中的任何幾何參數(距離,角度)。提供構建和修改分子幾何形狀的工具,您可以使用標準分子片段,並拖動圖像中的原子和片段進行相關操作,非常方便,這款強大的圖形化程序使用將為用戶帶來方便的可視化計算操作,並快速得到準確的結果,為您的工作帶來更大的便捷,軟件支持處理各種計算類型,支持使用以文本格式導入/導出原子坐標。雖然說Chemcraft本身不執行計算,但是可以大大方便使用廣泛的量子化學軟件包。本次帶來最新破解版下載,含注冊碼,有需要的朋友不要錯過了!

安裝破解教程

1、在本站下載並解壓,雙擊Chemcraft.exe運行,點擊Enter registration key按鈕
2、下列注冊碼任選一個輸入即可,點擊ok
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功能特色

1、通過原子坐標繪製分子的3維圖像,並可以檢查或修改分子中的任何幾何參數(距離,角度); 
2、遊戲,高斯,NWChem,ADF,Molpro,Dalton,Jaguar,Orca,QChem輸出文件的可視化:文件中各個幾何的表示(優化結構,每個優化步驟的幾何等),振動模式動畫,圖形表示梯度(作用在核上),等值麵或有色平麵形式的分子軌道的可視化,振動或電子(例如TDDFT)光譜的可視化,顯示SCF收斂圖的可能性以及其他一些特征; 
3、用於構建分子和修改分子幾何形狀的不同工具:使用標準分子片段,“拖動”分子圖像中的原子或片段,設置對稱點組的實用程序以及其他可能性; 
4、以可定製的顯示模式製作分子的出版物就緒圖像,其中包含所需的名稱(標簽,線條等); 
5、用於準備輸入文件的一些附加實用程序:構造Z矩陣,自動生成具有非標準基集的輸入文件,將從輸出文件讀取的MO轉換為輸入文件的格式。 
6、該程序結合了先進的圖形用戶界麵和為實際使用而設計的有益功能。Chemcraft基於將文件劃分為單獨的元素並將其顯示在分層的多級列表中,從而提供了非常詳細的輸出文件的結構化可視化;此功能使您可以輕鬆分析複雜的文件,例如掃描作業,IRC作業或多作業計算。Chemcraft的圖形引擎不需要任何硬件加速。
7、Chemcraft是一種商業軟件。Windows版本的價格目前對於學術用戶為160美元,對於其他用戶為300美元。也可以下載Chemcraft for Windows的免費軟件版本,它具有一些限製和導航屏幕。

使用說明

1、Chemcraft基礎  
Chemcraft包含一組圖形工具,可幫助進行量子化學計算。它提供了方便的實用程序,可幫助準備新作業以進行計算和分析計算結果。該程序的主要功能是可視化量子化學軟件包產生的輸出文件。支持的主要軟件包是Games(美國版和PCGames)和Gaussian94-09。  
2、Chemcraft遊戲用戶  
Chemcraft提供了Games-US輸出文件的非常詳細的可視化。文件中的以下數據可以圖形方式顯示:  
-原子坐標(如果文件中存在相應的表,則對應於全部或對稱唯一原子);  
-如果在文件中提供了鍵順序分析,則文件中的鍵會顯示在圖像上(否則,鍵是通過距離算法計算的);  
-能量梯度可以以指針的形式顯示(圖2);  
-不同的原子特性可以顯示為原子上的標記:穆裏肯數和電荷,自旋密度,化合價;  
-債券定單(作為債券上的標簽);  
-分子軌道可視化為等值麵或彩色平麵;  
-振動模式可以設置動畫或以指針(位移矢量)的形式顯示;  
-偶極矩可以可視化為指針;  
-MO能量可以以圖的形式顯示。  
該程序提供輸出文件的結構化表示。讀取的文件分為單獨的元素,例如單獨的幾何形狀或振動模式。對於每個元素,將從文件中提取所有可用數據:原子坐標,能量梯度等。所有元素都以層次結構列表的形式顯示(見圖1)。單擊列表的元素會自動在圖像上顯示各個幾何形狀或模式,並允許可視化不同的屬性。該界麵可提供可靠的計算數據可視化,包括非標準類型的計算,不完整的計算等。它還可以可視化具有多個計算作業的複雜文件。對於能量掃描或IRC計算,所有幾何形狀均按掃描/IRC步驟分為幾組。

能量梯度可視化示例。
  Chemcraft從GAMESS-US輸出文件中提取分子軌道係數以及基本信息,並以等密度麵或以密度值著色的表麵(平麵,球體)的形式繪製分子軌道(見圖3)。Chemcraft提供了一些執行軌道操作的可能性(例如,將一個軌道與另一個軌道相乘)。建立軌道的公式取自隨GAMESS-US發行的PLTORB程序的源代碼。具有密度值的多維數據集的計算得到了很好的優化。請注意,如果文件中有多個分子軌道係數表,則Chemcraft會提取它們中的每一個並允許對其進行渲染(例如,在MCSCF計算中,可以顯示標準軌道或自然軌道)。除了可視化軌道,

分子軌道可視化的示例。
  Chemcraft支持一個界麵,用於快速創建帶有非標準基礎集的GAMESS-US輸入文件的各個部分(圖4)。基集是從它們的描述中提取的,可以從PNNL的網頁(http://www.emsl.pnl.gov/forms/basisform.html)中獲得。它們還可以由用戶指定的其他高斯來補充。
3、適用於高斯用戶的Chemcraft
  我們建議在高斯輸入文件中鍵入#P GFINPUT POP(FULL,NBO),以便通過Chemcraft可視化高斯輸出。#P選項啟用擴展的打印輸出;GFINPUT選項啟用基集信息的打印輸出(基集中基元的描述),而POP(FULL)啟用所有分子軌道係數的打印輸出(也可以使用POP(REGULAR))。後兩個關鍵字允許Chemcraft可視化分子軌道。POP(NBO)可以打印出“自然鍵軌道”分析,其中可以計算分子中的鍵。所有這些關鍵字都是可取的,但不是必需的。對於GAMESS文件,可以看到文件中的不同數據:作用在核上的力(能量梯度),原子電荷,自旋密度和其他原子特性,NBO鍵的特性(占有率,能量),正常模式,分子軌道(可以顯示笛卡爾(6d等)或內部(5d)函數),MO能量。從文件中讀取標準或輸入/ Z矩陣方向的坐標,並將其顯示在圖像上(這對於正確可視化作用在核上的力是必需的,因為它們通常以與其他屬性不同的方向打印)。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。等)或內部(5d)功能可以可視化),MO能量。從文件中讀取標準或輸入/ Z矩陣方向的坐標,並將其顯示在圖像上(這對於正確可視化作用在核上的力是必需的,因為它們通常以與其他屬性不同的方向打印)。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。等)或內部(5d)功能可以可視化),MO能量。從文件中讀取標準或輸入/ Z矩陣方向的坐標,並將其顯示在圖像上(這對於正確可視化作用在核上的力是必需的,因為它們通常以與其他屬性不同的方向打印)。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。從文件中讀取標準或輸入/ Z矩陣方向的坐標,並將其顯示在圖像上(這對於正確可視化作用在核上的力是必需的,因為它們通常以與其他屬性不同的方向打印)。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。從文件中讀取標準或輸入/ Z矩陣方向的坐標,並將其顯示在圖像上(這對於正確可視化作用在核上的力是必需的,因為它們通常以與其他屬性不同的方向打印)。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。對於能量表麵掃描和IRC作業,所有幾何形狀均按掃描步驟分組。對於每個單獨的幾何形狀或振動模式,概述了最基本的數據並將其顯示為“抽象”(SCF能量,收斂準則等)。Chemcraft讀取多步高斯作業,然後將其顯示為幾個擴展節點的列表,每個節點代表文件中的單個作業。
  除了高斯輸出文件外,Chemcraft還可以讀取格式化的檢查點文件(.fch),從文件中提取分子結構和軌道。為了可視化分子軌道和其他特性,還可以讀取高斯立方體文件。
  Chemcraft使用NMR計算(GIAO,CSGT)從高斯日誌文件中讀取各向同性屏蔽值。提供了一種簡單的實用程序,用於將其重新計算為化學位移並在指定的原子組內求平均值。
4、適用於ADF用戶的Chemcraft
Chemcraft讀取ADF輸出文件,ASCII TAPE21文件和ASCII TAPE41文件。目前,ADF輸出文件的可視化不如GAMESS或高斯文件的可視化:提供能量提取,偶極矩和某些原子特性的可視化,但沒有分子軌道的可視化等。
5、使用其他格式
  除了Games-US,Gaussian和ADF文件之外,Chemcraft還可以讀取NWChem,Jaguar,Orca,Dalton,GAMESS-UK,Turbomole,Molpro和QChem輸出文件,HyperChem文件,MSI或PDB格式的文件(不全麵支持這些格式)以及MolDraw和Priroda程序格式,NBO格式(.31-.40文件),Molden文件,MFJ,SDF和Tinker文件,Crystal,VASP和Shellx文件,晶體學CIF文件以及具有原子笛卡爾坐標的簡單文本文件。Chemcraft提供了一個界麵,可通過剪貼板以文本格式導入/導出原子坐標,這有助於使用任何類型的計算中的數據。將原子坐標導出到剪貼板對於快速創建輸入文件也很有用。  
  Chemcraft包含一個實用程序,可用於將晶體學測量中使用的分數坐標轉換為笛卡爾坐標,以及反之,使用晶胞參數(a,b,c等)。
6、構造分子  
Chemcraft支持一套用於構建分子結構的工具,可用於準備用於計算或其他目的的初步猜測:  
-從標準分子片段(自由基等)構建分子。提供了用自定義片段補充片段集並通過剪貼板複製/粘貼單個片段的可能性;  
-修改分子中的任何幾何參數(距離,角度,二麵角)。所述修飾可以伴隨一個原子,兩個原子或所選原子組的置換;  
-使用鼠標“拖動”原子或片段在分子圖像上或旋轉片段的可能性(圖5);  
-用於應用任意幾何參數集的迭代算法(圖6);  
-易於使用的工具,可將點基應用於分子(圖8)。

拖動”原子或沿鍵旋轉片段的示例。
  當“拖動”原子或執行其他結構修改時,可以在圖像上控製任何幾何參數(參見圖5)。Chemcraft的界麵允許人們輕鬆更改任何原子的類型或插入/除去鍵。
  Chemcraft提供了一種用於快速獲取z矩陣的實用程序。通過單擊分子中的原子並指定一些其他信息來構建z矩陣(圖7)。在使用該實用程序之前,應首先獲取笛卡爾坐標中的分子結構。所有上述用於構建分子的工具均可用於此目的。

應用一組指定的幾何參數。

Z矩陣的可視化構造。       
Chemcraft可以調整分子中的原子坐標以應用指定的對稱性(圖8)。此實用程序在您的研究中非常有用,因為對稱分子的計算速度比非對稱分子快。

應用對稱點組
7、合並分子結構
  Chemcraft支持一套用於構建分子結構的工具,可用於準備用於計算或其他目的的初步猜測:

合並多個結構  
在使用此實用程序之前,應選擇幾個原子以使其彼此最大距離放置(在圖9中,這些原子標記為白色)。  
除此功能外,Chemcraft還可以計算兩個分子之間的均方根差。
8、分子渲染的可能性  
Chemcraft可以生成分子的高質量32位圖片。它被設計為用於創建發布就緒圖像的程序,不需要任何其他修改。可以在原子/鍵和其他對象(例如標簽和線條)上輕鬆添加圖片標題來補充圖片。Chemcraft包含一組標準顯示方案。每個方案代表一組定義分子外觀的參數:照明參數,單個原子和鍵的顏色和大小等。圖10展示了該集合的四個方案。Chemcraft允許用戶更改單個方案的參數或將自己的方案添加到集合中。  
Chemcraft的圖形引擎不需要任何圖形加速或其他圖形庫。它經過了優化,即使在過時的計算機上也可以提供很高的渲染速度。

用不同的顯示方案和不同的標簽樣式渲染分子的示例。
9、創建動畫
Windows版本的Chemcraft可以以多個位圖文件或gif動畫文件的形式保存分子的動畫圖片。提供以下標準動畫類型:分子旋轉動畫,振動頻率和PES掃描動畫。以下動畫是使用Chemcraft創建的:

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